EF-1α基因作為蘋果牛眼果腐病菌DNA條形碼的評價研究

摘要：蘋果牛眼果腐病菌(Neofabraea malacorticis、N. perennans、N. kienholzii和N. vagabunda)是我國重點關注的進境水果檢疫性有害生物,相似的形態和生理特征使該類真菌的鑒定非常困難。本研究在EF-1α基因區域設計了一對通用引物(NS1/NS4),對不同地理來源的蘋果牛眼果腐病菌及其近緣種菌株進行序列分析,考察EF-1α基因是否具備成為蘋果牛眼果腐病菌條形碼的特征與條件。結果顯示, EF-1α基因在蘋果牛眼果腐病菌上的PCR擴增和測序成功率均為100%,具有明顯的種間和種內遺傳變異間距(Barcoding Gap),系統樹分析顯示該基因片段對4種蘋果牛眼果腐病菌及其近緣種具有很好的區分能力,因此認為EF-1α基因可作為蘋果牛眼果腐病菌理想的DNA條形碼候選片段。