基于線粒體D-loop區(qū)分析茶花雞遺傳多樣性和起源進化

摘要：為探討茶花雞遺傳多樣性和起源進化,以茶花雞為試驗素材,對30只茶花雞線粒體DNA D-loop區(qū)全序列進行測序,結(jié)合GenBank已公布D-loop區(qū)全序列的19條紅色原雞序列,進行比對和分析處理。結(jié)果顯示:茶花雞線粒體D-loop區(qū)全長為1 232 bp,無缺失和插入。30只個體共發(fā)現(xiàn)9處單核苷酸多態(tài)位點,為3種單倍型。系統(tǒng)發(fā)育分析顯示,3種單倍型可分為A和B兩個分支,A和B分支均與Gallus gallus spadiceus聚為一類,推測這兩個分支可能均起源于紅色原雞滇南亞種。研究從分子水平為茶花雞遺傳資源保護和開發(fā)利用提供了參考。