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    基于高通量測序分析急性白血病患者與健康人群口腔菌群結(jié)構(gòu)的變化規(guī)律以及差異性

    任樂; 李大旭; 張喆; 徐紀(jì)茹 西安交通大學(xué)醫(yī)學(xué)部基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院病原生物學(xué)與免疫學(xué)系; 西安710061; 西安交通大學(xué)第一附屬醫(yī)院口腔科
    • 急性白血病
    • 口腔微生物
    • 高通量測序技術(shù)
    • 物種多樣性

    摘要:目的分析急性白血病患者與健康人群口腔菌群結(jié)構(gòu)的變化規(guī)律以及差異性。方法收集急性白血病患者60例,其中急性淋巴細(xì)胞白血病(ALL)患者10例,急性髓細(xì)胞白血病(AML)初入院患者19例、AML病情緩解患者18例、AML難治患者13例,同期納入健康者14例作為對照組。采集患者的唾液1 ml,提取細(xì)菌總DNA,利用細(xì)菌16S rDNA基因V4區(qū)通用引物對其進(jìn)行Touch Down PCR擴增,結(jié)合16S DNA V4區(qū)域擴增子測序分析技術(shù)比較患有急性白血病的人群口腔菌群分布的多樣性及相似性與健康對照組相比是否存在明顯差異。結(jié)果在門水平上,健康組、AML組及ALL組物種由厚壁桿菌門、變形菌門及擬桿菌門組成;AML組與健康組相比,厚壁桿菌門的豐度下降,變形菌門的豐度上升。ALL組與健康組相比,厚壁桿菌門的豐度上升,變形菌門的豐度下降。在屬水平上,健康組、AML組、ALL組物種組成類似,主要均由鏈球菌屬、奈瑟氏菌屬及Prevotella-7組成,AML組與健康組相比鏈球菌屬的豐度下降,Prevotella-7及奈瑟氏菌屬的豐度上升。ALL組與健康組相比,鏈球菌屬、Prevotella-7及奈瑟氏菌屬的豐度上升。對12個樣品及組間的口腔菌群差異性進(jìn)行分析,結(jié)果表明,健康組、AML、ALL組口腔微生物存在一定的差異性,且AML組口腔微生物的差異性與健康組相比要高于ALL組。結(jié)論厚壁菌門在ALL組中的豐度升高,變形菌門在AML組中的豐度升高。鏈球菌屬在ALL中的豐度升高,奈瑟氏菌屬在AML組豐度升高。

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