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    首頁 > 期刊 > 自然科學與工程技術 > 農業科技 > 林業 > 山東林業科技 > 玫瑰β-1,3-葡聚糖合成酶基因(RrCalS)克隆與生物信息學分析 【正文】

    玫瑰β-1,3-葡聚糖合成酶基因(RrCalS)克隆與生物信息學分析

    康希泉; 亓帥; 臧德奎; 鄭林; 徐宗大; 邢樹堂; 于曉艷 勝利油田勝大園林工程有限公司; 山東東營257000; 山東農業大學; 山東泰安271000; 青州市花卉產業管理局; 山東青州262500
    • 玫瑰
    • 基因克隆

    摘要:為了探明胼胝質對玫瑰授粉親和性的影響,本研究以‘唐紅’玫瑰花柱為試材,采用RT-PCR和RACE方法獲得了玫瑰β-1,3-葡聚糖合成酶基因的cDNA全長,命名為RrCalS。該基因全長5742 bp,開放閱讀框5295 bp,編碼1764個氨基酸。推導編碼蛋白的分子量為204.7kD, PI值為9.00,在164-265位具有pfam14288結構域,在869-1642位具有pfam02364保守結構域,屬于葡聚糖合成酶超家族;該蛋白屬于疏水性、非分泌型蛋白,具有16個跨膜結構域,含有32個Ser磷酸化位點、21個Thr磷酸化位點、12個Tyr磷酸化位點;該蛋白的α-螺旋占49.49%,無規則卷曲占22.68%,β-轉角占7.94%;該蛋白與Fragaria vesca等8種植物的Cals氨基酸序列同源性達73%以上,且它們的系統進化關系與傳統分類結果一致。本研究為進一步深入研究玫瑰授粉不親和機理,提高玫瑰育種理論和技術水平奠定了基礎。

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