青南高原多房棘球蚴myophilin基因的克隆和序列分析

摘要：目的 克隆多房棘球絳蟲（Em）的myophilin基因并對其序列進(jìn)行分析與預(yù)測。方法提取Em原頭節(jié)總RNA,采用RT-PCR技術(shù)擴增myophilin基因,將PCR產(chǎn)物連接入p GM-T載體,轉(zhuǎn)化入DH 5α感受態(tài)細(xì)胞,挑選陽性克隆送測序。采用生物信息學(xué)軟件對測序結(jié)果進(jìn)行序列比對分析,同時預(yù)測編碼蛋白的理化性質(zhì)、二級結(jié)構(gòu)、三級結(jié)構(gòu)、翻譯后修飾位點、結(jié)構(gòu)域和抗原表位。結(jié)果 擴增出長度為576 bp的cDN段,包含完整開放閱讀框（ORF）,編碼190個氨基酸,與已知細(xì)粒棘球絳蟲的序列同源性達(dá)99%。預(yù)測結(jié)果顯示,編碼蛋白分子式為C_（935）H_（1519）N_（255）O_（285）S_（11）,理論分子質(zhì)量為212 876,PI為8.66。α-螺旋、β-折疊和無規(guī)則卷曲在二級結(jié)構(gòu)中所占的比例分別為51.58%、10.00%和38.42%。含有10個翻譯后修飾位點,各1個Calponin結(jié)構(gòu)域和CH結(jié)構(gòu)域,8個B細(xì)胞抗原表位和6個T細(xì)胞抗原表位。結(jié)論 成功克隆出Em的myophilin基因并對其進(jìn)行了有效分析和預(yù)測。