基于全基因組序列的核桃細菌性黑斑病菌分泌蛋白的預測及特征分析

摘要：【目的】充分了解核桃黑斑病菌的侵染機制。【方法】以全基因組序列已經公布的7個核桃細菌性黑斑病菌菌株CFBP2528、CFBP7179、CFBP8253、DW3F3、J303、NCPPB1447、Xaj417等所具有的蛋白序列為預測數據,基于分泌蛋白所具有的主要特征,利用SignalP v4.1、ProtCompB v9.0、TMHMM v2.0、big-PI Fungal predictor、TargetP v1.1、LipoP v1.0等在線分析程序對分泌蛋白進行預測,同時分析其氨基酸組成及分布、信號肽長度、信號肽切割位點等特征。【結果】核桃細菌性黑斑病菌的分泌蛋白平均為74個,其氨基酸長度多集中于101~400氨基酸,所占比例為63.65%。信號肽氨基酸殘基中以A最多,所占比例為22.04%;其次是L,所占比例為19.27%。信號肽長度以19~29個氨基酸的最多,所占比例為79.62%,信號肽切割位點屬于A-X-A類型。【結論】核桃細菌性黑斑病菌中分泌蛋白的有效預測,可為深入解析核桃細菌性黑斑病菌中分泌蛋白在侵染過程中所發揮的功能提供理論依據。