NaCl脅迫下紅砂種子萌動(dòng)期差異表達(dá)基因的轉(zhuǎn)錄組分析

摘要：【目的】篩選NaCl脅迫下紅砂萌發(fā)期的差異表達(dá)基因,為耐鹽堿樹種選育提供基因資源。【方法】以前期擬合的萌發(fā)閾值濃度(273 mmol/L,記為M)、最適萌發(fā)濃度(43 mmol/L,記為L)、蒸餾水(記為C)處理紅砂種子,每個(gè)處理3次重復(fù),待胚根突破種皮,不超過2 mm時(shí)取出,進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測序。【結(jié)果】分別在L與C對(duì)比組(記為LvsC)、M與C對(duì)比組(記為MvsC)、M與L對(duì)比組(記為MvsL)中篩選出210、2 273、2 888個(gè)差異表達(dá)基因,其中LvsC中116個(gè)上調(diào)表達(dá),94個(gè)下調(diào)表達(dá);MvsC中1 781個(gè)上調(diào)表達(dá),492個(gè)下調(diào)表達(dá);MvsL中2 165個(gè)上調(diào)表達(dá),723個(gè)下調(diào)表達(dá);上調(diào)表達(dá)基因在KEGG富集中主要集中在核糖體、碳代謝、細(xì)胞色素P450代謝、谷胱甘肽代謝等途徑,下調(diào)表達(dá)基因主要富集在蔗糖淀粉代謝、內(nèi)質(zhì)網(wǎng)蛋白質(zhì)加工等過程。【結(jié)論】鹽脅迫條件下,差異基因誘導(dǎo)相關(guān)反應(yīng)協(xié)同發(fā)揮作用,最終使胚軸細(xì)胞伸長,突破種皮完成萌發(fā)。