基于SCoT分子標記的48份楊桃種質遺傳多樣性分析

摘要：【目的】分析48份楊桃種質的遺傳多樣性,為楊桃種質資源的鑒定保護及開發利用提供理論依據。【方法】從60條SCoT引物中篩選出擴增條帶清晰穩定、多態性豐富的引物,對從國內外收集的48份楊桃種質材料進行PCR擴增,統計分析電泳圖譜,利用Popgene 1.32計算其遺傳多樣性參數,采用NTSYSpc 2.1計算種質間的遺傳相似系數和遺傳距離,利用UPGMA法進行聚類分析,并根據遺傳相似系數進行主成分分析。【結果】從60條SCoT引物中篩選出的11條引物共擴增出115條條帶,其中多態性條帶102條,占總條帶數的88.7%,每條SCoT引物擴增的總條帶數(TNB)和多態性條帶數(NPB)分別為10.45和9.27條,多態性比率(PPB)為70.00%~100.00%,平均為88.84%;多態性信息量(PIC)、有效等位基因數(Ne)、Nei’s基因多樣性指數(H)和Shannon’s信息指數(I)的平均值分別為0.77、1.7758、0.4229和0.6061。48份楊桃種質間的遺傳相似系數為0.4957~0.9217,平均為0.6841。聚類分析結果顯示,在遺傳相似系數0.6618處可將48份楊桃種質劃分為三大類群,第Ⅰ類群均為甜楊桃種質,第Ⅱ類群以酸楊桃種質為主,第Ⅲ類群以甜楊桃種質為主。主成分分析結果與聚類分析結果基本一致,均與楊桃的果實風味和種質來源高度相關。【結論】楊桃種質資源具有較豐富的遺傳多樣性,且篩選獲得的SCoT引物對楊桃種質資源有較高的多態性檢測率,適用于楊桃種質資源鑒別及親緣關系分析。