適合轉(zhuǎn)錄組測序的芒果不同組織RNA試劑盒提取方法研究

摘要：為了探尋能夠滿足芒果各組織轉(zhuǎn)錄組測序要求的高質(zhì)量RNA提取方法,以‘桂熱芒82號’的葉片、花和果實(shí)為材料,從RNA提取質(zhì)量和產(chǎn)率、瓊脂糖電泳和RT-PCR結(jié)果分析、RNA測序質(zhì)量評價(jià)這3個(gè)方面,對常用的3種試劑盒的提取效果進(jìn)行了實(shí)驗(yàn)研究和評價(jià)分析。結(jié)果表明:以來自于天根生化科技有限公司的DP419試劑盒提取的芒果各組織的RNA質(zhì)量均較好,提取的RNA產(chǎn)率遠(yuǎn)高于其余兩種試劑盒的提取產(chǎn)率;除以美伯生物醫(yī)藥技術(shù)有限公司的RM103試劑盒提取芒果各組織所得RNA,經(jīng)瓊脂糖電泳未見有5S條帶出現(xiàn)外,以其余兩種試劑盒提取的芒果各組織的RNA都存在28S、18S、5S條帶且RT-PCR分析結(jié)果理想;對以3種試劑盒提取所得的RNA進(jìn)行完全測序,結(jié)果表明,3種試劑盒提取的RNA完全測序都大于98.99%,能滿足RNA-Seq分析的要求。文中綜合上述評判因素分析認(rèn)為,天根生化科技有限公司的DP419試劑盒是適用于芒果葉片、花和果實(shí)RNA提取的最優(yōu)試劑盒。