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    首頁(yè) > 期刊 > 自然科學(xué)與工程技術(shù) > 信息科技 > 計(jì)算機(jī)軟件及計(jì)算機(jī)應(yīng)用 > 集成技術(shù) > 一株新型殺鮭氣單胞菌烈性類T4噬菌體Asfd-1的分離鑒定和生物學(xué)特性分析 【正文】

    一株新型殺鮭氣單胞菌烈性類T4噬菌體Asfd-1的分離鑒定和生物學(xué)特性分析

    周燕; 袁盛建; 嚴(yán)庭瑋; 馬迎飛 中國(guó)科學(xué)院深圳先進(jìn)技術(shù)研究院合成生物學(xué)研究所(籌)定量合成生物學(xué)研究中心; 深圳518055; 中國(guó)科學(xué)院大學(xué); 北京100049; 暨南大學(xué); 廣州510632
    • 殺鮭氣單胞菌
    • 噬菌體治療
    • 生物信息

    摘要:噬菌體是自然界中最普遍的生物之一,其專一性裂解細(xì)菌的能力在針對(duì)耐藥菌感染治療方面具有很大的應(yīng)用前景。殺鮭氣單胞菌(Aeromonas salmonicide)是水產(chǎn)養(yǎng)殖業(yè)中一種主要病原菌,其引發(fā)的癤瘡病是一種常見的水產(chǎn)養(yǎng)殖動(dòng)物疾病,具有高死亡率和高發(fā)病率,一旦爆發(fā),將給水產(chǎn)養(yǎng)殖業(yè)帶來(lái)重大的經(jīng)濟(jì)損失。該研究以殺鮭氣單胞菌MF663675.1為宿主菌,從深圳海鮮市場(chǎng)的污水中,采用雙層瓊脂平板法分離純化得到單個(gè)噬菌體,通過(guò)電鏡對(duì)其表觀形態(tài)特征進(jìn)行觀察,并運(yùn)用生物信息的方法進(jìn)一步確定其基因型特征及遺傳分類地位。研究結(jié)果表明,分離出的烈性噬菌體命名為Asfd-1,噬菌斑呈圓形,輪廓分明、透明,直徑約1mm。電鏡觀察顯示,Asfd-1具有對(duì)稱的二十面體頭部,以及長(zhǎng)度為51 nm的收縮尾部?;蚪M測(cè)序和基因?qū)Ρ确治霰砻?Asfd-1含雙鏈脫氧核糖核酸(dsDNA),全基因組大小為168 962 bp,鳥嘌呤(G)和胞嘧啶(C)所占的比例為41.53%,共編碼263個(gè)開放閱讀框和16個(gè)轉(zhuǎn)移核糖核酸(tRNA)序列,Genbank登錄號(hào)為MK577502。根據(jù)國(guó)際病毒分類委員會(huì)規(guī)定的病毒分類方法,與同源的Aeromonas phage 31 GCA000862645.1和Aeromonas phiSA4GCA002710125.1全基因組對(duì)比結(jié)果顯示,Asfd-1是新型噬菌體。綜合電鏡觀察結(jié)果及系統(tǒng)進(jìn)化樹分析,Asfd-1屬于肌尾科下的T4噬菌體屬、肌尾噬菌體科、有尾噬菌體目的新成員。該研究可為應(yīng)用噬菌體治療細(xì)菌感染提供進(jìn)一步的參考。

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