北京鴨BNIP3L基因CDS區(qū)克隆及序列分析

摘要：BNIP3L定位于線(xiàn)粒體，廣泛分布于各個(gè)組織中，具有促凋亡的作用。根據(jù)NCBI上鴨BNIP3L基因預(yù)測(cè)序列設(shè)計(jì)引物，利用PCR技術(shù)，對(duì)鴨BNIP3L基因CDS區(qū)序列進(jìn)行克隆。結(jié)果表明：擴(kuò)增出BNIP3L基因的CDS區(qū)序列全長(zhǎng)為543bp，編碼180個(gè)氨基酸，相對(duì)分子質(zhì)量為19．52ku，理論等電點(diǎn)為6．334。另外，該氨基酸序列存在典型的3個(gè)低密度區(qū)域和1個(gè)跨膜結(jié)構(gòu)域。經(jīng)比對(duì)分析發(fā)現(xiàn)鴨的BNIP3L基因具有特有的保守序列，而且與鳥(niǎo)類(lèi)的BNIP3L基因具有較高的相似性，并對(duì)其氨基酸序列和蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)進(jìn)行了分析，整個(gè)多肽鏈中疏水性氨基酸為151個(gè)，親水性氨基酸為29個(gè)，因此整個(gè)多肽鏈應(yīng)為疏水性。其蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)由α-螺旋、β-轉(zhuǎn)角、延伸鏈和無(wú)規(guī)則卷曲組成，分別占22．78％、7．22％、17．78％和52．22％。以上數(shù)據(jù)表明北京鴨 BNIP3L基因CDS區(qū)序列與安氏蜂鳥(niǎo)、朱鷯、雞具有較高的一致性，且在物種進(jìn)化過(guò)程中較為保守。