馬鈴薯StNF-Y核轉錄因子基因的克隆和生物信息學分析

摘要：為了研究馬鈴薯StNF-Y基因在非生物逆境中的作用與功能,在馬鈴薯抗青枯病基因型ED13中克隆了1個新的NF-YC轉錄因子(StNF-Y),并對其進行生物信息學分析,預測其生物學功能。結果表明,StNF-Y基因的全長cDNA為1132bp,其開放閱讀框為693bp,編碼230個氨基酸,氨基酸分子式為C1112H1735N317O339S10,等電點為5.37,含有13個磷酸化位點;StNF-Y蛋白分布在胞質中,無信號肽,屬于親水性蛋白,含有高度保守的結構域,屬于BUR6superfamily家族;二級結構顯示,StNF-Y蛋白主要由45.65%的α-螺旋、5.65%的延伸鏈、45.22%的無規則卷曲和3.48%的β-轉角組成。系統進化分析結果顯示,馬鈴薯StNF-Y序列與番茄、辣椒和煙草NF-YC序列親緣關系較近。此外,StNF-Y在多種植物脅迫中起作用。因此,推測StNF-Y可能參與馬鈴薯相關脅迫抗性的調節。研究結果可為以后進一步深入研究馬鈴薯StNF-Y的功能以及對逆境脅迫的抵抗機制提供理論依據。