miR-1246和miR-1261在模擬失重48 h后人肺微血管內(nèi)皮細(xì)胞中的表達(dá)及生物信息學(xué)分析

摘要：目的：檢測模擬失重48 h人肺微血管內(nèi)皮細(xì)胞（HMVEC-L）miR-1246和miR-1261表達(dá)的改變,利用生物信息學(xué)方法分析預(yù)測其靶基因。方法：以回轉(zhuǎn)器行模擬失重效應(yīng)48 h的HMVEC-L為模擬失重組,同時(shí)設(shè)正常重力對照組,比較兩組細(xì)胞miRNA表達(dá)譜的變化,應(yīng)用Real-time PCR檢測HMVEC-L細(xì)胞miR-1246和miR-1261的表達(dá),通過Target Scan、miRDB和miRanda對miR-1246和miR-1261的靶基因進(jìn)行預(yù)測以及功能注釋和通路富集分析。結(jié)果：與正常重力對照組比較,模擬失重48 h可引起HMVEC-L細(xì)胞中29種miRNA呈現(xiàn)顯著差異性表達(dá),miR-1246和miR-1261顯著降低,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義（P〈0.05）;生物信息學(xué)分析顯示miR-1246和miR-1261的靶基因涉及生物過程、分子功能及細(xì)胞組成等多種功能,主要參與了磷酸化通路、凋亡相關(guān)通路和細(xì)胞骨架等相關(guān)分子的調(diào)控。結(jié)論：模擬失重48 h后可引起HMVEC-L細(xì)胞miR-1246和miR-1261的表達(dá)降低,提示其可能參與了模擬失重后內(nèi)皮細(xì)胞功能異常的調(diào)控。