我國首例輸入性裂谷熱病例病毒全基因組測序分析

摘要：目的對我國首例輸入性裂谷熱病例病毒進行全基因組測定，分析其進化來源及潛在變異。方法提取樣本核酸，非特異性反轉錄擴增病毒基因組RNA，使用Ion Torrent二代測序儀進行病毒全基因組測定。對獲得的基因組數據進行序列拼接、比對、進化樹構建和關鍵位點分析。結果通過測定獲得了病毒全基因組11979nt，該測定病毒屬E基因分支，序列與先前南非分離株Kakamas相似度最高（〉98％）。病毒Gn蛋白c端信號肽區存在1個氨基酸突變。結論本研究分析測定的裂谷熱病毒全基因組與目前非洲流行株高度相似，病毒基因特征未出現明顯變異。